Pymol

出自Wekeywiki

• 目前所在頁面：首頁 > 教育 > 生物化學_Pymol

	生物化學_Pymol
	軟體分類	生物化學
	軟體性質	請填軟體
	授權方式	請填授權
	作業系統
	軟體版本	請填版本
	官方網站	http://pymol.sourceforge.net/
	社群參與	請填社群

軟體說明

Pymol簡介

pymol 雖自稱是 Molecular viewer 看圖軟體, 其看圖的功能很強, 其實 pymol 也可以繪圖. pymol 可以展示 DNA 雙股螺旋的結構, 例如下載這個 PDB 檔, http://www.rcsb.org/pdb/download/downloadFile.do?fileFormat=pdb&compression=NO&structureId=3BNA,

下載後用 pymol 開啟, 就可以看到 DNA 的結構. 展示分子時可以用滑鼠旋轉, 放大或縮小, 也可以改變展示模式, 更能清楚表達其立體結構及化學性質, 無論是高中的化學課或是生物課, 無論是大學或是研究所的生化相關課程, pymol 都適合用來教學. 而且 pymol 有匯出圖片的功能, 可以用來作簡報或是論文等.

安裝下載

官方網站

下載網頁一: http://delsci.com/rel/ 不過他們說免費的版本只到 pre1.0 版
下載網頁二: 免費版本下載處: http://delsci.com/rel/099/

操作技巧

基本操作

FLASH動態說明:軟體下載安裝到基本使用

進階應用

以cox-2蛋白質藥物作用觀點引導PyMOL使用學習:共九個單元,每單元約花20分鐘可看完(第一集的分子到第九的Structure Alignment)

常見問題

相關連結

Pymol 線上文件

pymol 的官方使用說明, 語文是英文 (官方宣稱這文件有些舊了)

http://pymol.sourceforge.net/newman/user/toc.html

化學立體分子繪圖看圖軟體 pymol (取自笨牛手冊一，日內瓦一條牛/江易原)

壓縮檔(解開後是 PDF 檔)
pdf 文件檔
odt 文件檔(可編輯的開放格式原始檔)

Pymol 線上影音

Pymol 推薦連結

合堂體ribowsone:一顆藥的始末 ; 藥物開發流程概念

Pymol 部落格

導航